Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H3f3aP84244 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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