Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cbx1P83917 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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