Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx3P81067 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms