Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irx2P81066 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms