Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptprn2P80560 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms