Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Otx1P80205 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms