Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rad50P70388 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms