Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfixP70257 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfixP70257 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfixP70257 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfixP70257 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NfixP70257 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NfixP70257 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NfixP70257 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms