Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rin3P59729 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rin3P59729 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms