Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp25P57080 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp25P57080 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp25P57080 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp25P57080 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp25P57080 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp25P57080 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp25P57080 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp25P57080 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp25P57080 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms