Protein–RNA interactions for Protein: P56942

Pmch, Pro-MCH, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmchP56942 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmchP56942 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmchP56942 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmchP56942 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmchP56942 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmchP56942 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmchP56942 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmchP56942 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmchP56942 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmchP56942 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PmchP56942 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmchP56942 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmchP56942 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmchP56942 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmchP56942 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmchP56942 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmchP56942 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmchP56942 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmchP56942 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PmchP56942 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PmchP56942 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PmchP56942 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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