Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp5P56399 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms