Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Sh3bp1P55194 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Sh3bp1P55194 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
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