Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PctpP53808 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PctpP53808 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms