Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LmnaP48678 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LmnaP48678 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms