Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrprbP47758 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrprbP47758 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SrprbP47758 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrprbP47758 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrprbP47758 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms