Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Nedd4P46935 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Nedd4P46935 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Nedd4P46935 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Nedd4P46935 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd4P46935 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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