Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx1-2P42580 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms