Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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