Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddit3P35639 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddit3P35639 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms