Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp4P35123 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp4P35123 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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