Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms