Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SsbP32067 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SsbP32067 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SsbP32067 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SsbP32067 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SsbP32067 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SsbP32067 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SsbP32067 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SsbP32067 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SsbP32067 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SsbP32067 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SsbP32067 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SsbP32067 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SsbP32067 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SsbP32067 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SsbP32067 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SsbP32067 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SsbP32067 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SsbP32067 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SsbP32067 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SsbP32067 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SsbP32067 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms