Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprmP28828 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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