Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RxrbP28704 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RxrbP28704 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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