Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RxraP28700 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RxraP28700 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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