Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NapbP28663 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NapbP28663 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NapbP28663 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NapbP28663 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NapbP28663 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NapbP28663 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NapbP28663 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NapbP28663 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NapbP28663 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NapbP28663 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms