Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NdnP25233 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NdnP25233 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NdnP25233 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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