Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd12P23812 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms