Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ntf3P20181 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ntf3P20181 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms