Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms