Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sptan1P16546 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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