Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Khdc1bP0C7A0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms