Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col3a1P08121 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms