Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04212 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04212 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P04212 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P04212 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P04212 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P04212 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P04212 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P04212 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P04212 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P04212 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P04212 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P04212 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P04212 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P04212 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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