Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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P01789 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01789 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01789 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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