Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01641 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01641 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01641 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01641 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01641 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01641 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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P01641 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01641 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
P01641 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P01641 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P01641 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P01641 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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