Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifnb1P01575 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms