Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sap30O88574 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sap30O88574 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Sap30O88574 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sap30O88574 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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