Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3aO88508 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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