Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptpn20O55082 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms