Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NlkO54949 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NlkO54949 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NlkO54949 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NlkO54949 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NlkO54949 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NlkO54949 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NlkO54949 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NlkO54949 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NlkO54949 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NlkO54949 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NlkO54949 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NlkO54949 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NlkO54949 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NlkO54949 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NlkO54949 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NlkO54949 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NlkO54949 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NlkO54949 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NlkO54949 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NlkO54949 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NlkO54949 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NlkO54949 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NlkO54949 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NlkO54949 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NlkO54949 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NlkO54949 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NlkO54949 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NlkO54949 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms