Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChkaO54804 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChkaO54804 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms