Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 AC160991.2-201ENSMUST00000223784 1135 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gm37317-201ENSMUST00000192198 1024 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lhx8O35652 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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