Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc18a3O35304 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms