Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms