Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LhbO09108 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LhbO09108 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms