Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Hdac1O09106 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Hdac1O09106 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Hdac1O09106 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac1O09106 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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