Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3278L7N2D2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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