Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms